Les deux années d'études philosophiques font partie intégrante de la formation presbytérale. En conformité avec l’enseignement du Concile Vatican II (OT 15) qui entérinait la pratique séculaire de l’Église, le Pape Jean-Paul II, dans son Encyclique Fides et Ratio (1998), rappelle l’importance et même la nécessité de la formation philosophique pour les futurs prêtres: « Je désire rappeler avec force que l’étude de la philosophie revêt un caractère fondamental et qu’on ne peut l’éliminer de la structure des études théologiques et de la formation des candidats au sacerdoce. Ce n’est pas un hasard si le curriculum des études théologiques est précédé par un temps au cours duquel il est prévu de se consacrer spécialement à l’étude de la philosophie. »           (Fides et Ratio no 62; voir aussi no 60 et 105).

En 2001-2002, les professeurs et la Direction des études ont travaillé à une restructuration du programme.  Ils ont consolidé et augmenté le nombre de crédits alloué à la philosophie en ajoutant deux séminaires et en regoupant certains cours.  En 2008-2009, les  réformes annoncées dans les universités européennes (Processus de Bologne) nous obligent à modifier l’appellation du diplôme.  Nous n’offrirons plus le baccalauréat canonique en philosophie, qui désormais comportera 90 crédits, mais plutôt la majeure civile en philosophie (60 crédits) émise par les Prêtres de Saint-Sulpice de Montréal en vertu de la loi 278.

En 2009-2010, nous avons ajouté un cours portant sur la Méthodologie du travail intellectuel et l'introduction philosophique à la théologie afin de mieux répondre aux besoins de notre clientèle étudiante.  Ce cours sert de mise à niveau.  Il est  obligatoire pour tous les étudiants, n'ayant pas fait de philosophie, et qui désirent poursuivre éventuellement dans un programme en théologie.  Il vise à donner à tous un vocabulaire et des concepts philosophiques communs.